m6A甲基化已经被证明与植物对病原体的抗性有关。然而,小麦(Triticumaestivum)全转录组m6A谱及其在小麦抗小麦黄花叶病毒(WYMV)中的潜在生物学功能尚未见报道。这项研究是shou次鉴定两个不同抗WYMV小麦品种的转录组m6A修饰谱。通过对m6A-MeRIP-seq数据的分析,作者在WYMV感ran的抗病小麦品种(WRV)和WYMV感ran的敏感小麦品种(WSV)中鉴定出25752个共有m6A峰和30582个共有m6A基因,这些峰主要富集在编码序列3‘UTR区和终止密码子中。GO分析和RNA测序数据显示,m6A和mRNA水平均发生明显变化的基因与植物防御反应有关。ctDNA 的甲基化检测,同时结合了 ctDNA 测序于 DNA 甲基化测序的优势。dna羟甲基化研究
案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文:m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊:NatureCommunication影响因子:13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法,使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域,再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰,进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示,m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点,并且多数具有BCA的序列motif特征(B=C/U/G)。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时,细胞转录组的m6Am水平有明显上升,说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示,m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。福建甲基化热点m6A甲基化主要通过减少IAP mRNA的半衰期而起作用。
m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里,作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中,转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外,FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成,提高了光合效率和抗旱性,但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A) RNA中约7%的去甲基化,在非核糖体核RNA中m6A下降约35%),诱导染色质开放和转录激huo。因此,调控植物RNA m6A甲基化是一种很有前景的策略,可明显提高植物的生长和作物产量。
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云序生物提供两种m7GRNA甲基化测序服务:(1)m7GRNA甲基化单碱基测序,可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,云序生物针对m7GRNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G甲基化修饰水平的整体检测。云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。适用于m6A RNA甲基化谱研究,快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。湖南甲基化修饰
2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。dna羟甲基化研究
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